组蛋白赖氨酸的甲基化对异染色质的形成和基因表达的控制有着重要的作用。包含SET结构域的蛋白表现出具有组蛋白赖氨酸甲基转移酶的活性。植物基因组中许多编码SET结构域的基因被鉴定了出来,但是其中大多数SET-结构域基因的功能还不知道。Su(var)3-9是果蝇中发现的组蛋白H3赖氨酸9(H3K9)甲基转移酶,本研究中作者分析了水稻中12个Su(var)3-9的同源蛋白(SUVH)。一些水稻SUVH(SDG727和SDG710)对组蛋白H3K9去甲基酶JMJ706有拮抗作用,下调这些基因的表达能够部分互补jmj706的表型,并且降低H3K9的甲基化。下调SDG728的表达降低了H3K9的甲基化并改变了种子的形态,过表达该基因能够增加H3K9的甲基化。另外还发现SDG728和其他SUVH基因参与了对Tos17和Ty1-copia元件等逆转录转座子的抑制。通过对组蛋白甲基化的分析表明SDG728介导的H3K9甲基化可能对逆转录转座子的抑制起着重要的作用。【相关登录号】
contigs及其产物:
AP014961�KBAS94658, BAS94659
cDNAs及其产物:
AK069035→BAG91226
参考基因组位点:
Os05g0490700(RAP-DB, PhytoAB公司抗体服务)←→ LOC_Os05g41172(本地、MSU-RGAP, 百格基因突变体服务)←→ LOC4339168(NCBI)
参考基因组产物:
XM_015784352→XP_015639838, XM_015784353→XP_015639839
uniprot库登录号:
A0A0E0PPA7, B9FKW5, Q0DH56, Q6F322